《最佳嫌疑人》講述了一系列由一張價值百萬美金的祖傳失眠秘方而引發的跨國商戰。在明爭暗搶中，群雄上演計中計、騙中騙，土豪老闆、無良奸商、心機小秘、失眠患者，悲催員工……每個人看似都是「嫌疑人」，但原來真相不止一個。

影片中，百年藥廠承工製藥的老闆李總（劉樺飾），決定炒樓盤賣地，不再賣藥。他重金聘請的香港高管阮大志（林俊賢飾）牽線找來日本的買家宮下先生。不想，宮下先生看中的只是承工能夠治癒失眠的獨家配方。就在雙方談判陷入僵局之時，聲稱手握秘方的「神秘人S」的出現更讓談判迷霧重重。

藥廠銷售總監林以泰（蘇有朋飾）是一名重度失眠症患者，整日似夢非醒唯唯諾諾工作的他，卻陰差陽錯洞悉S與日本買家的交易。成為捉鬼人後，林以泰發覺無論是直屬上司阮大志（林俊賢 飾）、關係曖昧的高級文秘安琪兒（陳喬恩飾）、還是日方代表的妖嬈助理梅川美紀子（洪曉熙飾）每個人都心懷鬼胎，甚至他最信任的藥廠員工老宋（由立平飾）都行為古怪，每個人都是最佳嫌疑人！而此時，躲在某個角落的「神秘人S」卻對所有人的一舉一動都了如指掌…